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“噗，哈哈哈哈…”赤木律在沉默一会后突然笑起来，她抱着肚在地上开始打滚，笑的很夸张，甚至连眼泪都出来了。
“不行了不行了，我真的不行了，笑死我了，你竟然说自己是这个世界的神，你在开玩笑吗？你还是小孩啊？就算是现在的小孩也不会做这种梦了，你是故意的吧，你一定是故意的吧？”赤木律一边笑一边说道，而雷哲沉默等待对方平静下来，而葛城美里也没说话，坐在桌的另一边。
大概一分钟，赤木律爬起来，擦擦自己的眼泪，结果这个时候她发现另外两个人的表情有些奇怪，雷哲依然笑着，笑容中带着自信，并没有因为对方嘲笑自己而生气，葛城美里则是相当严肃，很认真的那种，而看到两人这样，赤木律突然有不好的预感。
“你们是在开玩笑吧？”
“你觉得我是在开玩笑吗？”雷哲笑笑，接着他不知道从什么地方拿出一本书，一本比死海文书还要古老正统的书，他把书放在桌上，继续说道：“能看懂多少就看多少，里面的东西会给你答案的。”
……
赤木直，超级计算机magi开发者，也是赤木律的母亲，现在e计划的主要负责人。
由赤木直开发的三台超级电脑被命名为‘magi’，三台分别名为caspar、balthasar和melchior，分别植入了赤木博士作为女人、母亲和科学家的人格。
赤木博士死后由其女儿，赤木律负责维护，magi系统可以管理第三新东京市政务、监视使徒动向、处理实验资料等。
除了在nerv总部的‘原始’magi外，世界各地都有复制的magi系统。
在旧剧场版中世界各地的magi曾试图侵入nerv的magi主系统，结果被律博士的程序给挡了回去，在赤木律试图炸毁nerv总部时，magi中的casper（代表女人的人格）否定了这一指令，即‘选择了男人而背叛了女儿’，可见magi拥有人格。
由已故的赤木直完成其基础理论，而律接手完成的超级电脑，据称magi相当于nerv的大脑。
它策划，修正与解决许多系统的秘密与计划，magi是由三大系统组成：melchior1，balthasar2，casper3。
最后的决策出自于这三大系统的商议，采用一票否决制，在magi完成之后的第二天，赤木直在终极教条自杀身亡。
这部电脑之所以近似于人类，不只是因为它模拟出人类所有的左右为难模式，并且还采用人格移植的操作系统，一种将人类的逻辑思考模式移植到电脑上的系统。
该思维模式乃是移植自赤木直，melchior1，balthasar2与casper3分别移植了直身为科学家，母亲，与女人的性格。
说实话赤木直和赤木律都是非常出色的科学家，否则也不会研究出这种超级计算机，只不过今天两位天才学着却面临着新的挑战，因为她们要开始接触另一个完全不同的世界，一个她们从来都没有发现过，甚至没有想过的世界。
赤木律有些茫然的找到自己的母亲，然后将对方从实验室中拽了出来，要知道原来她绝对不会这样做，而赤木直也发现今天的女儿很不正常，至少她看上心不在焉，而且貌似受到很大的刺激。
“究竟什么事？”
赤木直这样问道，而她的女儿不知道该怎么回答，双眼一直盯着桌上的咖啡，沉默不语，而赤木直没有催促对方，自己喝着咖啡等待对方的话，她明白有些事情在困扰自己的女儿，虽然两人的关系很特殊，但她还是明白许多东西。
在沉默很久很久之后，赤木律拿起凉掉的咖啡，一口气全部喝光，接着她说出一句话让赤木直喷出来。
“你相信这个世界有神的存在吗…？不是传说中的神，而是活生生，出现在你面前的神！”赤木律很认真很认真的这样问道…
而她的表现也让赤木直觉得，自己的女儿疯了…
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赤木律的话让自己的母亲觉得很不可思议，她怎么也没想到自己的女儿会说出这种让人啼笑皆非的问题来，神？
这个世界在很久很久以前也许真的有‘神’的存在，但在赤木直看来那所谓的‘神’也和传统意义中的不同，莉莉丝，亚当，使徒，难道他们对人类来说还不算神吗？也许不算吧，他们也许只是另一种高等生物？
对于‘人类补完计划’，赤木直知道的并不多，她知晓的情报其实很有限，虽然她是seele的成员，但她还没有达到那种知道一切的级别，如果她知道seele的高层想要做什么的话，也许就会相信这个世界有神的存在，亚当，莉莉丝，使徒也并非是‘外星’生命
其实不管是赤木直所研究的超级计算机，又或者是碇唯研究的a10神经，再到eva的制作，都只是在围绕一个计划而进行，最终的目地就是进行‘人类补完’，不管是seele的高层，还是碇源堂都是以这个目地而努力，只不过双方所要的结果并不相同。
尽管只有一个‘人类补完计划’，但是碇源堂和seele却同床异梦。
不过，至少在寻找生命之树这一点上还是一致的，而关于如何找到生命之树就能进行赎罪仪式并让全人类回归到原始状态的过程，都记载在《死海古卷》不为人知的另一面中。
按照这一人类赎罪的‘剧本’，要接近生命之树必须打倒神所安排的守护者，也就是使徒。
但实则却有些不太相同，其实seele也好，就算是原本有着撒旦身份，现在却变成人类的碇源堂也好，他们有一件事却不知道，那就是生命之树的守护者并非是在大战中幸存下来的天使，而是先封印，再被分裂，最后变成胚胎，苦逼哈哈的亚当。
幸存下来的使徒，她们的目地是将苏醒后的神给消灭，并非看守生命之树，在这点上就算是莉莉丝也把撒旦给骗了，她没有去听从撒旦的安排保护生命树，不是她不想，而是她没有这个能力，在她以及剩下的天使，用撒旦的身体做成封印将神和亚当封印起来后，生命树也从这个世界消失，至于跑到什么地方莉莉丝也不知道，她寻找过生命树的下落，但一无所获。
在雷哲被封印瞬间，他就明白莉莉丝和撒旦必然会寻找伊甸园中的生命之树，所以他动用自己的权力将生命树改变形态，最终封印在亚当的体内，这种做法一是保护亚当，二是不想让莉莉丝和撒旦的阴谋得逞，因为在这个世界，生命树就是‘世界意识’，类似《反叛的鲁鲁修》中，雷哲曾经掌握的东西。
如果自己被封印，而莉莉丝和撒旦又得到这东西，雷哲觉得自己真的会暴走，就算解除封印后他也会忍不住把这个世界给拍死，毕竟被封印他只是看作倒霉，可如果就连自己的世界都被别人抢走，那他就有点被打脸的感觉。请牢记
对于亚当，雷哲对他的感情不好不坏，在雷哲看来亚当就是个老好人，不愿意与别人发生争执，总是笑眯眯的，没有什么太大的毛病，不怎么习惯和人交流，如果可以他宁愿躲在某处睡上几万年。
而在亚当第一任妻莉莉丝看来，亚当就是个不会与人交流的自闭儿，而且很无聊，除睡觉外就不知道该做什么，这种人起初还不觉得有什么不好，但时间久了，必然会觉得寂寞，否则莉莉丝也不会离开伊甸园，跑到地球邂逅撒旦。
不过有句老话说的好，越是老实人，发怒起来越可怕，在后来的战斗中这个有些内向自闭的男人，就给雷哲造成不少的麻烦，甚至最后还拖住雷哲，给莉莉丝制造出机会，雷哲暗骂亚当这混蛋脑袋被驴踢了，莉莉丝都把你甩了，你还为对方卖命，实在让哥们吐槽不能，你丫到底要多傻才能做出这种事情。
在这种郁闷的心态中，雷哲和亚当被封印在一起，这些年来雷哲最想说的话就是：“老不搞基，下次再封印哥们，找个妹可以么…”
解读《死海古卷》是eva中虚构了一设定，死海古卷缺少了相当的一部分，而那上面就记载着关键的有关出现生命之树的情报。
此外，还需要找到隆基努斯之枪和加福之所——希伯莱神话中住着天神之魂魄的地方，准备出生到人间的孩们，会首先在那里获得灵魂，而当这里的门打开时，也就打开了世界的开始和终结之门。
在这里所说的加福之所，就是封印雷哲和亚当的地方，也就是所谓的‘白之月’，而剧情中所指的‘孩们’并非是后来的eva的驾驶员，比如说碇真嗣，明日香等人，而是在第二次冲击当日诞生的第十七使徒，渚薰。
在这个世界的渚薰和原作有着绝对的不同，在他诞生当时，雷哲也出现过在他的面前，而让雷哲出乎意料的是，这个渚薰有着很多让他也惊讶的地方。
后面的事情就跟上述的差不多，白之月的封印被打开，被封印中的神苏醒，亚当苏醒，为此打开世界的开端和终结之门，第二次冲击所引发的能量冲击只不过是一点点彩头。
第二次冲击：为了消灭使徒的生命之源亚当之卵，必须使用隆基努斯之枪——拥有回归原始之里的存在。
但是，在2000年南极的实验中，由于使徒的基因与人的遗传基因的接触，释放出了超出预想值以外的反at力场。
结果引发了强烈的爆炸，破坏了白之月，从而让最后一个使徒渚熏在第二次冲击同日出生。
原来说过，死海文书中记载的东西并不完善也不真实，它只是另一本书的译本而已，很多东西都没有被记录下来，所以当时的seele并不知道白之月并非是使徒的生命之源，而是封印神的容器，这样说吧，白之月其实是撒旦肉身所变化的东西，他舍弃自己的肉身封印神和亚当，而解除封印的方式，就是让拥有生命之果和智慧之果两种生命结合，原本这是不可能出现的事情，结果葛城博士所率领的研究小组误打误撞找到一点线索，让封印消失。
《亚当计划》和《e计划》，这两个计划对于人类补完计划都是必须的，原本亚当计划和e计划是一个概念，但是后来逐渐分开了。
亚当计划：复原原始形态的亚当的计划，虽然也可以说是为了制造eva才复原的亚当，但seele的赎罪仪式也有使用亚当来进行的计划。而碇源堂为了自己的计划，也曾利用过亚当。
e计划：为了消灭使徒并进行仪式，按照计划需要至少12台eva。在当夏娃计划开始之前是使用莉莉丝来制造eva，但是在亚当再生计划开始后，二号机以后的eva都是从亚当制造而来，不过这里也有不同的地方，那就是初号机本身就来源于亚当，在所有机体中，只有零号机和二号机是来自莉莉丝。
初号机，六号机，八号机都是亚当的分身。
三号级，四号机和五号机则是通过基因技术复制亚当制造出来的成果。
至于从未露面的七号机，暂且不明。
在人类解读《死海文书》时，他们知道消灭使徒是生命之树出现的条件，通过eva初号机等的努力，这个目标基本实现。
对于seele来说，生命之树是不可缺少的重要道具；对于碇元渡来说，他需要的是生命之果——其实也都是要打倒使徒。就这样，尽管在朗基努斯之枪、s2机关和ne
v的对人防御系统等问题上相互拆台，但是seele和碇元渡双方还算是勉强合作一直撑到了将最后使徒打倒…
不过刚才也说过，生命之树其实就存在于亚当的体内，应该说在被制成eva的初号机体内，分裂成四个的亚当，胚胎拥有亚当的所有记忆，初号机继承对方的‘大�